Thứ tự các bước cơ bản xử lí nguồn nước trước khi nuôi thuỷ sản là:

Diệt tạp, khử khuẩn → Lắng lọc → Bón phân gây màu → Khử hoá chất.

Lắng lọc → Diệt tạp, khử khuẩn → Khử hoá chất → Bón phân gây màu.

Lắng lọc → Khử hoá chất → Diệt tạp, khử khuẩn → Bón phân gây màu.

Lắng lọc → Diệt tạp, khử khuẩn → Bón phân gây màu → Khử hoá chất.