Quy luật phân ly của Mendel không nghiệm đúng trong trường hợp:

Bố mẹ thuần chủng về cặp tính trạng đem lai.

Số lượng cá thể thu được của phép lai phải đủ lớn.

Tính trạng do một gene qui định trong đó gene trội át hoàn toàn gene lặn.

Tính trạng do một gene qui định và chịu ảnh hưởng của môi trường.