Nguyên nhân trực tiếp làm cư dân Nam Bộ rất thưa vắng trong nhiều thế kỉ đầu của giai đoạn này

điều kiện tự nhiên thay đổi, đất bị ngấm mặn và sản xuất nông nghiệp gặp khó khăn

các đô thị lớn thu hút toàn bộ cư dân chuyển khỏi vùng đất Nam Bộ

vùng đất bị cấm khai phá và không có nguồn nước cho sinh hoạt

cư dân bị bắt buộc chuyển hết sang vùng trung lưu sông Mê Công