Mục đích chủ yếu của việc chuyển đổi cơ cấu thủy sản ở Đồng bằng sông Cửu Long là

tạo nhiều việc làm, tăng vị thế của vùng, sử dụng hợp lí tự nhiên.

tạo sản phẩm hàng hóa, đáp ứng thị trường, phát huy các thế mạnh.

đẩy mạnh hoạt động dịch vụ, chống biến đổi khí hậu, tạo việc làm.

đa dạng sản phẩm, phá thế độc canh, thúc đẩy công nghiệp chế biến.