Khó khăn về tự nhiên của vùng Đông Nam Bộ là

Diện tích đất phèn, đất mặn lớn.

Thiếu nước về mùa khô.

Hiện tượng cát bay, cát lấn.

Áp thấp nhiệt đới gây mưa lớn kéo dài.