Để đảm bảo quá trình tách chiết DNA thành công, các nhà khoa học cần quan tâm đến một số yếu tố sau:

Trong quá trình tách chiết DNA, nếu các yếu tố nói trên không được đảm bảo sẽ ảnh hưởng đến hiệu quả tách chiết (lượng DNA được thu hồi thấp, độ tinh sạch của DNA thấp). Cụ thể:

- Tế bào không được li giải hoàn toàn sẽ ảnh hưởng đến việc giải phóng DNA ra khỏi tế bào → giảm lượng DNA thu được.

- Nồng độ ethanol được sử dụng:

+ Nồng độ quá cao: gây đứt gãy nucleic acid → giảm lượng DNA thu được.

+ Nồng độ quá thấp: khó loại bỏ được các thành phần không mong muốn → giảm độ tinh sạch của DNA.

- Quá trình gắn DNA lên màng silica không đúng sẽ làm giảm lượng DNA được gắn lên màng → DNA không được giữ lại sẽ bị rửa trôi → giảm lượng DNA thu được.

- Mẫu DNA bị nhiễm protein do protein không được loại bỏ hoàn toàn → giảm độ tinh sạch của DNA.