Con người đã sử dụng vi sinh vật để xử lí ô nhiễm môi trường dựa vào

khả năng chuyển hóa các chất độc hại thành chất dinh dưỡng và oxygen của vi sinh vật.

khả năng chuyển hóa chất độc hại thành chất khí của vi sinh vật.

khả năng hấp thụ và phân giải chất thải, chất độc hại và kim loại nặng của vi sinh vật.

khả năng sinh nhiệt để đốt cháy tất cả các chất thải, chất độc hại và kim loại nặng của vi sinh vật.