Cơ chế phát sinh đột biến cấu trúc NST là:

làm đứt gãy NST, tiếp hợp hoặc trao đổi chéo không đều giữa các cromatit.

quá trình tổng hợp protein hình thành thoi phân bào bị ức chế ở kì đầu của phân bào.

rối loạn quá trình nhân đôi của ADN trong quá trình phân bào.

làm đứt gãy NST dẫn đến rối loạn sự tiếp hợp trong giảm phân I.