Các nhóm vi sinh vật quan trọng trong thực phẩm bao gồm:

Vi khuẩn, nấm men, nấm mốc và virut

Vi khuẩn, tảo, nấm mốc và virut

Vi khuẩn, nấm men, giun tròn và virut

Vi khuẩn, nguyên sinh động vật, nấm mốc và virut