Vai trò chủ yếu của chọn lọc tự nhiên trong tiến hoá nhỏ là

Làm cho tần số tương đối của các alen trong mỗi gen biến đổi theo hướng xác định

Làm cho thành phần kiểu gen của quần thể thay đổi đột ngột

Phân hoá khả năng sinh sản của những kiểu gen khác nhau trong quần thể

Qui định chiều hướng và nhịp điệu biến đổi thành phần kiểu gen của quần thể, định hướng quá trình tiến hoá.