Ưu điểm của phương pháp tổ chức quản trị dự án theo ma trận là:

Đảm bảo nguyên tắc tập trung trong quản trị.

Phân quyền quyết định trong quản trị dự án rõ ràng.

Nguồn lực luôn được ưu tiên để thực hiện các công việc của dự án.

Doanh nghiệp phản ứng nhanh hơn, linh hoạt hơn trước yêu cầu của khách hàng và thay đổi của thị trường.