Trong sắc kí lỏng hiệu năng cao để định tính các chất người ta thường dựa vào:

Rf và Rs

Hệ số dung lượng K’

Diện tích pic

Dựa vào thời gian lưu, thu sản phẩm ra khỏi cột định danh bằng những kĩ thuật khác như khối phổ, hồng ngoại và cộng hưởng từ