Trách nhiệm của Bộ trưởng đối với Ủy ban nhân dân (UBND) cấp tỉnh, thành phố là:

Hướng dẫn và chỉ đạo UBND cấp tỉnh, thành phố về chuyên môn, nghiệp vụ thuộc ngành, lĩnh vực do Bộ quản lý

Phê duyệt biên chế hành chính nhà nước của cấp tỉnh trong lĩnh vực mình quản lý

Bổ nhiệm Giám đốc sở quản lý ngành, lĩnh vực thuộc Bộ

Phê bình Chủ tịch UBND cấp tỉnh, thành phố khi có khuyết điểm trong quản lý, điều hành ngành, lĩnh vực thuộc Bộ quản lý