Tồn tại chính trong học thuyết Darwin là

giải thích chưa thành công cơ chế hình thành các đặc điểm thích nghi.

chưa hiểu rõ nguyên nhân phát sinh biến dị và cơ chế di truyền của các biến dị.

đánh giá chưa đầy đủ vai trò của chọn lọc trong quá trình tiến hoá.

chưa giải thích được đầy đủ quá trình hình thành loài mới.