Tổ chức y tế địa phương theo nghị định 01 -1998 CP khác với tổ chức y tế theo nghị định 15/ CP ở chỗ:

Các phòng chức năng thuộc giám đốc sở gồm 7phòng.

Các phòng chức năng thuộc giám đốc sở gồm 9 phòng.

Các phòng chức năng thuộc giám đốc sở gồm 8 phòng.

Các phòng chức năng thuộc giám đốc sở gồm 10 phòng.

Các phòng chức năng thuộc giám đốc sở không thay đổi.