Tổ chức bộ máy ngành Thuế Việt Nam hiện nay được tổ chức theo mô hình:

Quản lý theo chức năng là chủ yếu

Quản lý theo đối tượng nộp thuế

Quản lý theo sắc thuế

Quản lý theo sắc thuế, kết hợp quản lý theo đối tượng