Phí bảo vệ môi trường thu được không dùng để:

Đầu tư phòng ngừa ô nhiễm

Xử lý nước thải đạt hiệu quả chuẩn môi trường

Đầu tư mới, nạo vét cống rãnh và nâng cấp hệ thống tiêu thoát nước ở các đô thị

Khắc phục các điểm nóng về ô nhiễm môi trường