Ở sinh vật nhân sơ, một nhóm gene cấu trúc có liên quan về chức năng thường được phân bố liền nhau thành cụm và có chung một cơ chế điều hòa gọi là operon. Việc tồn tại operon có ý nghĩa:

Giúp một quá trình chuyển hóa nào đó xảy ra nhanh hơn vì các sản phẩm của gene có liên quan về chức năng cùng được tạo ra đồng thời

Giúp các gene có thể đóng mở cùng lúc vì có cùng vùng điều hòa vì vậy nếu như đột biến ở vùng điều hòa thì chỉ ảnh hưởng đến sự biểu hiện của 1 gene nào đó trong operon

Giúp tạo nhiều sản phẩm của gene vì nhiều gene phân bố thành cụm sẽ tăng lượng sản phẩm vì vậy đáp ứng tốt với sự thay đổi điều kiện môi trường

Giúp cho vùng promoter có thể liên kết dễ dàng hơn với RNA polymerase vì vậy mà gene trong operon có thể cảm ứng dễ dàng để thực hiện quá trình phiên mã để tạo ra sản phẩm khi tế bào cần.