Nhược điểm của việc sử dụng Bacillus subtilis làm tế bào chủ là, NGOẠI TRỪ:

Điều hoà biểu hiện gen chưa được hiểu rõ hết

Ít vector có mức biểu hiện cao

Nguy cơ nhiễm cao

Không thể thực hiện hầu hết các biến đổi hậu dịch mã