Nhược điểm của phương pháp ghép đoạn cành là

đòi hỏi kĩ thuật cao và cần chọn gốc ghép phù hợp.

không giữ được đặc tính của cây mẹ.

cây con sinh trưởng chậm và dễ thoái hóa.

không áp dụng được cho cây ăn quả lâu năm.