Nguyên tắc điều trị bệnh viêm não Nhật bản là:

Dùng thuốc chống vi rút đặc hiệu như Acyclovir

Điều trị triệu chứng là chủ yếu, nâng cao thể trạng, phát hiện để kịp thời điều trị phòng các biến chứng

Dùng kháng sinh

Chống phù não, an thần ,hạ nhiệt