Nguyên nhân chủ yếu làm ô nhiễm nghiêm trọng nguồn nước sông, hồ là do

Mưa axít xuống các sông, hồ.

Sự cố đắm tàu, rửa tàu.

Khai thác thiên nhiên quá mức của con người.

Chất thải công nghiệp và sinh hoạt chưa được xử lí.