Mục đích chính của kiểm toán hoạt động là:

Đảm bảo các thủ tục kiểm soát nội bộ được thực hiện đúng đắn

Đánh giá một hoạt động xem có những hữu hiệu và hiệu quả hay không

Cung cấp kết quả kiểm toán nội bộ về kế toán cho các nhà quản lý

Trợ giúp cho việc kiểm toán của kiểm toán viên độc lập