Mô hình tổ chức quản trị dự án theo chức năng có ưu điểm, ngoại trừ:

Linh hoạt trong việc sử dụng cán bộ.

Một người có thể tham gia vào nhiều dự án.

Tổ chức quản lý theo yêu cầu của khách hàng.

Tận dụng vốn kiến thức chuyên môn và kinh nghiệm của các chuyên gia.