Khó khăn về cơ sở vật chất - kĩ thuật đối với sự phát triển ngành

Nguồn lợi thủy sản ven bờ bị suy giảm nhanh.

Ở một số vùng ven biển, môi trường bị suy thoái.

Hệ thống các cảng cá còn chưa đáp ứng được yêu cầu.

Hằng năm, có tới 9-10 cơn bão xuất hiện ở Biển Đông.