Khó khăn chủ yếu của việc đánh bắt xa bờ ở Duyên hải Nam Trung Bộ hiện nay là

lao động đánh bắt ít được bổ sung, cơ sở hậu cần phục vụ còn yếu.

phương tiện đánh bắt còn hạn chế, dịch vụ nghề cá còn chưa mạnh.

công nghiệp chế biến còn hạn chế, các cơ sở chế biến khác nhỏ lẻ.

trong năm xảy ra nhiều thiên tai, môi trường nhiều nơi bị ô nhiễm.