Khi nói về cấu trúc di truyền của quần thể tự phối, A. Quá trình tự phối làm

Quá trình tự phối làm cho quần thể phân chia thành những dòng thuần có kiểu gen khác nhau.

Qua nhiều thế hệ tự phối, tỉ lệ kiểu gen dị hợp giảm dần.

Tự phối qua các thế hệ làm thay đổi tần số alen và thành phần kiểu gen theo hướng tăng tỉ lệ đồng hợp.

Người ta áp dụng tự thụ phấn hoặc giao phối gần để đưa giống về trạng thái thuần chủng.