Hoán vị gen xảy ra trong giảm phân là do:

Sự trao đổi chéo giữa hai cromatit trong cùng một nhiễm sắc thể kép.

Sự phân li độc lập và tổ hợp tự do của các NST khác nhau.

Sự trao đổi chéo giữa hai cromatit khác nguồn trong cặp NST kép tương đồng

Sự trao đổi đoạn giữa hai cromatit thuộc các NST không tương đồng.