Hệ thống kiểm soát nội bộ được thiết lập tại đơn vị chủ yếu nhằm:

Giúp nhà quản lý của đơn vị thực hiện các mục tiêu của đơn vị đó

Giúp cho kiểm toán viên độc lập của đơn vị lập kế hoạch kiểm toán

Giúp Nhà nước quản lý và thu thuế cùng các khoản phí, lệ phí được chính xác

Giúp cho các chủ thể bên ngoài đơn vị có thể giám sát được hiệu quả hoạt động của đơn vị