Đối với quá trình tiến hoá, đột biến gene có vai trò quan trọng hơn đột biến NST. Nguyên nhân là vì:

Đa số đột biến gene đều là lặn và phổ biến hơn đột biến NST.

Đa số đột biến gene là có lợi hoặc trung tính còn đột biến NST thì có hại.

Đột biến gene xảy ra ở cấp phân tử còn đột biến NST xảy ra ở cấp tế bào.

Đột biến gene là những đột biến nhỏ còn đột biến NST là đột biến lớn.