Cơ sở khoa học của ứng dụng sử dụng vi sinh vật để sản xuất thuốc trừ sâu sinh học là

khả năng tự tổng hợp các chất cần thiết của vi sinh vật.

khả năng tiết enzyme ngoại bào để phân giải các chất của vi sinh vật.

khả năng tạo ra các chất độc hại cho côn trùng gây hại của vi sinh vật.

khả năng chuyển hóa các chất dinh dưỡng cho cây trồng của vi sinh vật.