Cơ chế dẫn đến sự hoán vị gene trong giảm phân là:

Sự nhân đôi của NST.

Sự phân li NST đơn ở dạng kép trong từng cặp tương đồng kép.

Sự tiếp hợp NST và sự tập trung NST ở kỳ giữa.

Sự tiếp hợp và trao đổi chéo của các chromatid ở kì đầu I.