Chỉ thị phân tử được ứng dụng trong chọn giống thuỷ sản nhằm

loại bỏ các cá thể mang gene bệnh.

nâng cao chất lượng của giống thuỷ sản.

chữa bệnh cho các giống thuỷ sản nhiễm bệnh.

chọn các cá thể mang gene mong muốn.