Chi cục quản lý chuyên ngành thuộc Sở Nông nghiệp và PTNT theo Thông tư Liên tịch số 61/2008/TTLT-BNN-BNV ngày 15/5/2008 của Liên Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn và Bộ Nội vụ là:

Chi cục Quản lý thị trường; Chi cục Thú y; Chi cục Kiểm lâm; Chi cục Lâm nghiệp

Chi cục Bảo vệ thực vật; Chi cục Thú y; Chi cục Kiểm lâm; Chi cục Lâm nghiệp

Chi cục Bảo vệ thực vật; Chi cục Thuế; Chi cục Kiểm lâm; Chi cục Hải quan

Chi cục Bảo vệ thực vật; Chi cục Thuế; Chi cục Kiểm lâm; Chi cục Tiêu chuẩn Đo lường chất lượng