Chẩn đoán bệnh ấu trùng Anisakinae dựa vào:

Bệnh cảnh lâm sàng

Nội soi kết hợp sinh thiết ống tiêu hoá tìm ấu trùng

Xét nghiệm máu: bạch cầu toan tính tăng

Chẩn đoán huyết thanh luôn cho kết quả tốt nhất

Xét nghiệm phân tìm trứng.