Cấu tạo khác nhau về chi tiết của các cơ quan tương đồng là do:

Sự tiến hóa trong quá trình phát triển chung của loài

Chọn lọc tự nhiên đã diễn ra theo các hướng khác nhau

Chúng có nguồn gốc khác nhau nhưng phát triển trong những điều kiện giống nhau

Thực hiện các chức phận giống nhau