Cấu tạo khác nhau của cơ quan tương đồng là do

Sự tiến hóa trong quá trình phát triển loài

Chọn lọc tự nhiên đã diễn ra theo những hướng khác nhau

Chúng có nguồn gốc khác nhau nhưng phát triển trong các điều kiện như nhau

Chúng thực hiện các chức năng khác nhau.