Căn cứ vào Atlat Địa lí Việt Nam trang 10, phần lớn diện tích lưu vực hệ thống sông Mê Công ở Việt Nam thuộc 2 vùng

Duyên hải Nam Trung Bộ và Đồng bằng sông Cửu Long.

Tây Nguyên và Đồng bằng Sông Cửu Long.

Đông Nam Bộ và Đồng bằng sông Cửu Long.

Duyên hải Nam Trung Bộ và Đông Nam Bộ.