Căn cứ theo nghĩa hẹp, thuế Hải quan được chia thành:

Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu

Thuế tự quản, thuế theo cam kết quốc tế

Thuế thông thường, thuế ưu đãi và thuế ưu đãi đặc biệt