Các enzyme phá hủy DNA xúc tác phản ứng thủy phân các liên kết cộng hóa trị liên kết các nucleotide với nhau. Điều gì sau đây xảy ra với phân tử DNA mạch kép nếu được xử lý bằng các enzyme đó

Liên kết glycosidic giữa nitrogenous base với nhóm OH ở vị trí 1^’ trên phân tử đường bị cắt đứt.

Liên kết phosphoester giữa gốc phosphate với nhóm OH ở vị trí 5^’ trên phân tử đường bị cắt đứt.

Liên kết phosphodiester giữa gốc phosphate với nhóm OH ở vị trí 3^’ trên phân tử đường bị cắt đứt.

Liên kết hidrogen giữa 2 mạch polynucleotide trong chuỗi xoắn kép DNA bị cắt đứt.