Bốn lớp của ngành đơn bào là:

Trùng roi, trùng lông, chân giả và bào tử trùng

Trùng roi, trùng lông, chân giả và ký sinh trùng sốt rét

Trùng roi, trùng lông, amip lỵ và ký sinh trùng sốt rét

Trùng roi, trùng lông, amip lỵ và amip đại tràng

Trùng roi, trùng lông, ký sinh trùng sốt rét và bào tử trùng