Bất lợi về mặt kinh tế của đa dạng sinh học thường gặp nhất trong các hệ thống sản xuất cây trồng

Làm giảm mật độ sản phẩm hàng hóa, chất lượng hàng hóa, giảm hiệu quả đầu tư

Làm tăng mật độ/đa dạng của sinh vật ăn thực vật

Tăng ký chủ trung gian của mầm bệnh

Quần xã sinh vật cần quản lý đa dạng hơn, nên cần chi phí đầu tư cho việc quản lý sản xuất