Các kĩ thuật nuôi cấy mô tế bào khác nhau về mẫu sử dụng cho nuôi cấy và mục đích ứng dụng:

Kĩ thuật nuôi cấy mô tế bào	Mẫu sử dụng cho nuôi cấy	Mục đích ứng dụng
Nuôi cấy mảnh mô	Mảnh mô của cây gốc	- Tạo nguyên liệu cho các kĩ thuật khác như nuôi cấy tạo mô sẹo, tái sinh cơ quan. - Tạo vật liệu chuyển gene.
Nuôi cấy mô sẹo	Mảnh mô đã biệt hóa và được khử biệt hóa trong điều kiện in vitro	- Tạo thành mô, cơ quan và cây hoàn chỉnh. - Tạo nguyên liệu để tạo sinh khối huyền phù tế bào và chuyển gene.
Nuôi cấy tế bào đơn	Mảnh mô, mô sẹo, dịch nuôi tế bào được xử lí để tách rời các tế bào	- Tạo sinh khối tế bào.
Nuôi cấy huyền phù tế bào	Các tế bào đơn hoặc khối tế bào nhỏ được tách từ mô hoặc mô sẹo	- Tăng quy mô sản xuất chất chuyển hóa thứ cấp.
Nuôi cấy tế bào trần	Tế bào thực vật đã bị loại bỏ thành tế bào	- Tạo nguồn tế bào đơn trong tạo dòng tế bào, chuyển gene, tạo giống cây lai từ lai tế bào soma hoặc dùng để nghiên cứu về các cấu trúc và chức năng của tế bào.
Nuôi cấy phôi	Phôi trưởng thành hoặc chưa trưởng thành được tách ra từ hạt	- Được sử dụng để "cứu phôi" của hạt lai, hạt chưa chín và không tự nảy mầm được nhằm tạo cây hoàn chỉnh có khả năng sống sót.
Tạo phôi soma	Tế bào soma của cây	- Sử dụng trong nhân giống vô tính, tạo vật liệu đồng nhất về di truyền, sạch bệnh. - Cung cấp nguồn mô để chuyển gene, tái sinh cây từ tế bào trần và trong công nghệ hạt nhân tạo.
Nuôi cấy tạo cơ quan	Mô tế bào	- Hình thành và tái tạo cơ quan (thường là chồi thân và rễ) để ứng dụng nhằm sản xuất các chất chuyển hóa và để nhân giống ở một số loại cây trồng.

b) Sắp xếp các hình theo tiến trình thời gian thực hiện các giai đoạn nuôi